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我科學(xué)家構(gòu)建油菜功能基因數(shù)據(jù)庫

2020年07月31日 09:51:52 來源:科技日報 作者:劉志偉 童超波 劉勝毅

  科技日報武漢7月30日電(記者 劉志偉 通訊員 童超波 劉勝毅)記者30日從中國農(nóng)科院油料所獲悉,該所油料作物基因組學(xué)與抗病性改良創(chuàng)新團隊成功破譯了油菜基因組的全轉(zhuǎn)錄信息密碼,構(gòu)建了油菜10萬余個基因的轉(zhuǎn)錄全景圖,使得油菜基因功能研究第一次有了標(biāo)準(zhǔn)的可參考的基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫,將有力支撐油菜功能基因的相關(guān)研究。該成果最近發(fā)表在國際知名期刊《植物》上。

  油菜基因組包含約12億個堿基和10萬多個基因,如何解讀這些海量的基因組信息,成為油菜功能基因研究的重要任務(wù)。根據(jù)中心法則,基因通過轉(zhuǎn)錄形成mRNA(信使核糖核酸)再翻譯成蛋白質(zhì);虻霓D(zhuǎn)錄通常存在多種可變的剪切方式,一個基因可以形成許多種不同的mRNA。此前,由于技術(shù)和資源的限制,油菜一直缺乏全基因組水平所有基因的轉(zhuǎn)錄mRNA數(shù)據(jù)庫,導(dǎo)致油菜基因功能研究缺乏可查詢和可參考的基因注釋信息。

  為了突破這一瓶頸,該團隊采用最新的三代測序技術(shù)準(zhǔn)確測定了油菜全長轉(zhuǎn)錄組,并自主開發(fā)了一套用于多倍體油菜復(fù)雜基因組的分型方法,成功繪制了油菜基因組的轉(zhuǎn)錄全景圖,構(gòu)建了油菜“標(biāo)準(zhǔn)”的參考轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫。該研究成果更新了人們對油菜基因和基因組的認(rèn)識和理解,將為甘藍型油菜功能基因和遺傳改良研究及基因組設(shè)計育種提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)和理論指導(dǎo)。

[編輯: 王姝]
(本文來源:科技日報)
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