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迄今最大規(guī)模人類(lèi)遺傳變異體目錄公布

2020年06月01日 09:33:01 來(lái)源:科技日?qǐng)?bào) 作者:張夢(mèng)然

  列報(bào)告,集中描述了對(duì)一個(gè)匯集了逾14萬(wàn)人樣本的數(shù)據(jù)庫(kù)——基因組聚集數(shù)據(jù)庫(kù)(gnomAD)的應(yīng)用,該數(shù)據(jù)庫(kù)擁有迄今最大規(guī)模的人類(lèi)遺傳變異體公開(kāi)目錄,是我們深入認(rèn)識(shí)人類(lèi)基因功能、發(fā)現(xiàn)新疾病相關(guān)基因的寶貴資源。

  人類(lèi)基因組中絕大多數(shù)基因的功能依然未知。揭示基因功能的一種方法是觀察基因發(fā)生突變后的結(jié)果。這些變異體往往會(huì)產(chǎn)生不良結(jié)果,但通常較為罕見(jiàn)。大規(guī);驕y(cè)序研究有助于考察這些功能喪失型變異體的效應(yīng),或能帶來(lái)對(duì)人類(lèi)生物學(xué)特征和疾病的重要見(jiàn)解。

  此次《自然》發(fā)表的一篇概述性報(bào)告中,美國(guó)麻省理工學(xué)院—哈佛大學(xué)博德研究所科學(xué)家康拉德·卡澤維斯基及其同事,描述了從125748個(gè)全外顯子組和15708個(gè)全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)集中鑒定出的443769個(gè)預(yù)測(cè)的功能喪失型變異體。鑒于這些變異體預(yù)計(jì)會(huì)影響其編碼蛋白的正常運(yùn)作,團(tuán)隊(duì)進(jìn)而評(píng)估了這些變異體對(duì)生理機(jī)能的影響:究竟是幾乎沒(méi)有影響,還是會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重的健康問(wèn)題。《自然》同時(shí)發(fā)表的另外兩篇報(bào)告,利用該數(shù)據(jù)庫(kù)創(chuàng)建了一個(gè)結(jié)構(gòu)性變異體資源庫(kù),并評(píng)估了基因缺失、復(fù)制,甚至是顛倒方向所產(chǎn)生的影響。

  同時(shí)出爐的其他報(bào)告,探討了如何利用人類(lèi)功能喪失型變異體評(píng)價(jià)候選藥物靶點(diǎn),提升對(duì)遺傳變異體的臨床解讀,以及如何更詳細(xì)地考察特異性功能喪失型變異體。譬如英國(guó)帝國(guó)理工學(xué)院科學(xué)家尼古拉·威芬和同事分析了與帕金森病風(fēng)險(xiǎn)增加相關(guān)的一個(gè)基因的變異體,結(jié)果顯示靶向這個(gè)基因或是一種安全的治療方法。

  科學(xué)家們表示,gnomAD項(xiàng)目的樣本量是其前任的兩倍多,之前的外顯子組聚集聯(lián)盟(ExAC)收錄了6萬(wàn)多個(gè)外顯子組數(shù)據(jù)?删S斯基與同事也指出,他們距離鑒定出人類(lèi)全部的預(yù)測(cè)功能喪失型變異體還很遙遠(yuǎn),盡管如此,他們認(rèn)為這項(xiàng)資源能夠提升我們對(duì)罕見(jiàn)和常見(jiàn)遺傳病的評(píng)估。

(張夢(mèng)然)

[編輯: 王航飛]
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