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新算法檢測合并樣本 即可大規(guī)模篩查

早期識別新冠肺炎患者費(fèi)用比單獨(dú)檢測便宜20倍
2020年10月23日 12:01:48 來源:科技日報(bào) 作者:張夢然

  科技日報(bào)北京10月22日電(記者 張夢然)英國《自然》雜志22日發(fā)表一項(xiàng)傳染性疾病相關(guān)研究,科學(xué)家團(tuán)隊(duì)報(bào)告一種利用少量檢測對大量人口進(jìn)行新冠病毒感染篩查的數(shù)學(xué)方法。這種方法非常適合于大規(guī)模監(jiān)測感染情況,與此同時(shí),其有助于降低大規(guī)模檢測費(fèi)用,在無法負(fù)擔(dān)大量檢測的低收入國家可能特別有益。

  快速識別和隔離新冠病毒感染者是控制該病毒傳播的重要策略。檢測病毒RNA的PCR檢測非常準(zhǔn)確,但每次檢測費(fèi)用約為30美元至50美元。對于低收入國家來說,這些費(fèi)用尤其具有挑戰(zhàn)性。

  合并(或集中)樣本一起檢測,可以提高分析效率,降低成本。當(dāng)某疾病在人群中的發(fā)病率較低,且大多數(shù)檢測結(jié)果為陰性時(shí),這種方法尤其有效。標(biāo)準(zhǔn)的分組檢測程序是在檢測前將樣本合并成一定規(guī)模的小組。如果一組檢測結(jié)果為陽性,則對該組中的樣本逐一進(jìn)行檢測,以確定陽性個(gè)體。

  加拿大圓周理論物理研究所科學(xué)家維爾弗雷德·恩迪馮、尼爾·塔洛克及他們的同事,此次提出了一種數(shù)學(xué)算法,通過使用合并的平行PCR檢測來優(yōu)化新冠病毒感染的篩查。該方法的基礎(chǔ)是將一組樣本分成多個(gè)子樣本,并將它們重新組合,使其仿佛處于一個(gè)高維立方體中一樣。如果有一個(gè)樣本新冠病毒檢測呈陽性,那么立方體上對應(yīng)陽性池的坐標(biāo)就會(huì)立即把它識別出來。否則,隨著使用算法對子樣本進(jìn)行重新排列,可能需要進(jìn)行額外的檢測。子樣本組的大小可以優(yōu)化;隨著流行率的降低,子組可以變大,以確保通常只需要的兩輪檢測。

  該方法要求在組內(nèi)合并子樣本時(shí),仍可有效檢測稀釋樣本中的新冠病毒?茖W(xué)家團(tuán)隊(duì)利用在盧旺達(dá)新冠肺炎監(jiān)測期間收集的樣本,證明了當(dāng)一個(gè)陽性樣本與99個(gè)陰性樣本混合時(shí),仍然可以將新冠病毒檢測出來。他們總結(jié)說,該算法有望使早期識別感染者的費(fèi)用比單獨(dú)檢測便宜20倍。

[編輯: 王姝]
(本文來源:科技日報(bào))
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