頭狀葡萄球菌是一種常見的凝固酶陰性葡萄球菌，可導(dǎo)致乳腺炎、復(fù)雜皮膚軟組織感染、人工關(guān)節(jié)感染等嚴重感染。長期使用利奈唑胺這一抗菌藥，會使頭狀葡萄球菌產(chǎn)生耐藥性。核心基因組多位點分型系統(tǒng)是把以大量菌株為基礎(chǔ)的核心基因組作為序列分型標記，從而構(gòu)建的高分辨率的物種分型技術(shù)。利用核心基因組多位點分型系統(tǒng)進行細菌耐藥監(jiān)測研究，有助于預(yù)測細菌耐藥發(fā)展變化趨勢，明確耐藥機制，從而引導(dǎo)抗菌藥物研發(fā)。

　　此次研究中，課題組應(yīng)用了3個不同的頭狀葡萄球菌基因組集，經(jīng)過初步篩選和驗證基因組集篩選，最終建立了包含1492個基因的核心基因組多位點分型系統(tǒng)。為驗證該系統(tǒng)，課題組收集了目前所有利奈唑胺耐藥頭狀葡萄球菌的基因組作為檢驗基因組集，并納入了源于杭州、上海和哈爾濱等地醫(yī)院的菌株的核心基因組。

　　“盡管菌株之間時空差異很大，但絕大多數(shù)利奈唑胺耐藥頭狀葡萄球菌均屬于同一克隆，即該細菌同一進化分枝。團隊建立的系統(tǒng)分析鑒定發(fā)現(xiàn)了重要耐藥克隆，并將其命名為L克隆。”陳衍介紹。

　　陳衍說，基于核心基因組單核苷酸多態(tài)性(SNP)系統(tǒng)發(fā)育分析的區(qū)分結(jié)果與頭狀葡萄球菌核心基因組多位點分型系統(tǒng)得出的結(jié)果一致——大部分L克隆菌株攜帶利奈唑胺耐藥基因，該基因由菌株中特定的環(huán)狀DNA分子攜帶，并且只存在于L克隆中。

　　“雖然L克隆目前只發(fā)現(xiàn)于我國，但已對臨床產(chǎn)生威脅，亟須進行更大范圍的國際流行病學(xué)調(diào)查來監(jiān)測L克隆的全球性流行和傳播。”陳衍介紹，期待在完善的核心基因組多位點分型系統(tǒng)的幫助下，人們未來可以更好地監(jiān)測多重耐藥頭狀葡萄球菌克隆播散情況。